La Direction des Opérations regroupe les composantes nécessaires à l’ensemble des opérations menées par l’ANAF: renseignements, investigations, enquêtes, surveillances.
Sont directement rattachées à la Direction des Opérations: une Direction Technique et Informatique, une Direction des Enquêtes et Investigations, une Direction Analyses et Synthèses et une Direction Juridique et Financière.